天空的牛

DGGE是啥? 不重要 重要在圖作好了，怎麼分析 從圖到數據這部份還沒有很好的說法 但從數據到圖這部份~ 就有很好的說法啦 首先你需要一個程式叫R 然後你需要一個由0,1(有無Band)組成的date檔，但每個Lane帶的資料是在同一欄(循欄排列)。 x=matrix(scan(file.choose()),nrow=10) # scan(file.choose()) 能讓你用檔案總管找你想要運算的data檔 # 10 代表Lane的數目 # 讀入的檔會轉置成循列排列，可以觀察一下 x1=dist(x, method = "binary") # dist 就是算兩兩距離 # binary 是針對 on off 這種資料運算 plot(hclust(x1, method="average")) # plot 繪圖嘍 # hclust 分群 # average 用算數平均數來算，也就是UPGMA啦 剩下要怎麼看資料? 請善用help